Lysozyme

Un article de Wikipédia, l'encyclopédie libre.

Cet article est une ébauche concernant la biochimie.

Vous pouvez partager vos connaissances en l’améliorant. (Comment ?).

Structure tertiaire du lysozyme

Cristal de lysozyme

Le lysozyme est une protéine globulaire de 129 acides aminés que l'on rencontre dans un certain nombre de sécrétions (larmes, salive...) et dans le blanc d'œuf. Elle a été découverte par Alexander Fleming en 1922.

Il s'agit d'une hydrolase acide (EC 3.2.1.17) sécrétée par les granulocytes et les monocytes. Elle détruit la paroi bactérienne en catalysant l'hydrolyse des glycosaminoglycanes la constituant. Cette propriété a incité certains auteurs à la qualifier d'antibiotique corporel.

[modifier] Mode d'action

Le lysozyme peut agir comme une opsonine innée, ou comme une enzyme lytique capable de lyser des bactéries, en particulier celles à Gram positif, indépendamment de leur pouvoir pathogène. En revanche, les bactéries à Gram négatif sont généralement résistantes à cette enzyme grâce à la couche externe de lipopolysaccharides (LPS) qui les caractérise. Cette couche LPS couvre la paroi muréique (i.e., couche de peptidoglycanes) et la protège contre l'attaque par le lysozyme en empêchant l'accès de cette enzyme.

Le lysozyme sert d'opsonine non spécifique innée en se fixant à la surface bactérienne, réduisant ainsi la charge négative et facilitant la phagocytose de la bactérie avant que les opsonines du système acquis de l'immunité. En d'autres termes, la lysozyme facilite la phagocytose par les leucocytes.

Concernant, la lyse bactérienne, l'enzyme attaque les peptidoglycanes constituant la paroi des Bactéries (particulièrement les Bactéries Gram positif. En effet, le lysozyme hydrolysent les liaisons covalentes entre l'acide N-acétyl-muramique avec le 4^e atome de carbone du N-acétyl-glucosamine. La molécule de peptidoglycane se trouve associée avec le site de fixation de l'enzyme (binding site) situé dans un creux entre les deux domaines. Cela contraint la molécule de substrat à adopter la conformation de l'état de transition. Les acides aminés Glu 35 (acide glutamique, acide aminé numéro 35), et l'Asp 52 (acide aspartique, acide aminé numéro 52) se sont révélé être indispensables à l'activité enzymatique. La Glu 35 agit comme donneur de proton au pont glycosidique, clivant la liaison C-O du substrat, tandis que l'Asp 52 sert de nucléophile permettant la formation transitoire d'une enzyme glycosylée. Celle-ci réagit alors avec une molécule d'eau, donnant le produit final de l'hydrolyse et l'enzyme dans sa forme initiale.