Séquence cis

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Une séquence cis est une séquence d'ADN capable de moduler l'expression d'un gène présent (en général) sur le même chromosome. La notion de séquence cis s'oppose à celle de facteur trans.

Historiquement, la définition des facteurs cis est expérimentale : un facteur agit en cis si l'on ne peut pas le transcomplémenter, c'est à dire que l'on n'obtient pas l'effet de modulation si on transfecte un plasmide contenant la séquence correspondante associé à un promoteur dans la cellule. Cette expérience suggère une proximité entre le facteur modulateur et la séquence modulée. Ainsi l'action en cis a été associée à une séquence d'ADN, alors que celle en trans est associée à la protéine issue de la séquence.

Cependant, on sait maintenant qu'il existe des protéines capables d'agir en cis, comme les protéines des rétroposons, qui fixent l'ARNm dont ils sont issus, et viennent agir spécifiquement sur les rétroposons.

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