Chimiokine
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Les chimiokines (cytokines chimioattractantes) sont une famille de petites protéines solubles 8-14 kilodaltons. Leur fonction est l'attraction (chimiotactisme) et le contrôle de l'état d'activation des cellules du système immunitaire. Elles sont caractérisées par la présence de quatre résidus cystéine en des positions conservées nécessaires à la formation de leur structure tridimensionnelle.
Les chimiokines sont retrouvées chez tous les vertébrés, certains virus et certaines bactéries, mais aucune n'a encore été décrite chez les invertébrés.
Sommaire |
[modifier] Histoire
Historiquement, ces protéines ont été connues sous d'autres noms comme la famille SIS des cytokines, la famille SIG des cytokines, la famille SCY des cytokines, la superfamille du facteur-4 plaquettaire ou les intercrines.
[modifier] Classification
Chimiokines CC | |||
Name | Gene | Autre(s) nom(s) | Uniprot |
CCL1 | Scya1 | I-309, TCA-3 | P22362 |
CCL2 | Scya2 | MCP-1 | P13500 |
CCL3 | Scya3 | MIP-1α | P10147 |
CCL4 | Scya4 | MIP-1β | P13236 |
CCL5 | Scya5 | RANTES | P13501 |
CCL6 | Scya6 | C10, MRP-2 | P27784 |
CCL7 | Scya7 | MARC, MCP-3 | P80098 |
CCL8 | Scya8 | MCP-2 | P80075 |
CCL9/CCL10 | Scya9 | MRP-2, CCF18, MIP-1γ | P51670 |
CCL11 | Scya11 | Eotaxin | P51671 |
CCL12 | Scya12 | MCP-5 | Q62401 |
CCL13 | Scya13 | MCP-4, NCC-1, Ckβ10 | Q99616 |
CCL14 | Scya14 | HCC-1, MCIF, Ckβ1, NCC-2, CCL | Q16627 |
CCL15 | Scya15 | Leukotactine-1, MIP-5, HCC-2, NCC-3 | Q16663 |
CCL16 | Scya16 | LEC, NCC-4, LMC, Ckβ12 | O15467 |
CCL17 | Scya17 | TARC, dendrokine, ABCD-2 | Q92583 |
CCL18 | Scya18 | PARC, DC-CK1, AMAC-1, Ckβ7, MIP-4 | P55774 |
CCL19 | Scya19 | ELC, Exodus-3, Ckβ11 | Q99731 |
CCL20 | Scya20 | LARC, Exodus-1, Ckβ4 | P78556 |
CCL21 | Scya21 | SLC, 6Ckine, Exodus-2, Ckβ9, TCA-4 | O00585 |
CCL22 | Scya22 | MDC, DC/β-CK | O00626 |
CCL23 | Scya23 | MPIF-1, Ckβ8, MIP-3, MPIF-1 | P55773 |
CCL24 | Scya24 | Eotaxine-2, MPIF-2, Ckβ6 | O00175 |
CCL25 | Scya25 | TECK, Ckβ15 | O15444 |
CCL26 | Scya26 | Eotaxine-3, MIP-4α, IMAC, TSC-1 | Q9Y258 |
CCL27 | Scya27 | CTACK, ILC, Eskine, PESKY, skinkine | Q9Y4X3 |
CCL28 | Scya28 | MEC | Q9NRJ3 |
Chimiokines CXC | |||
Name | Gene | Other name(s) | Uniprot |
CXCL1 | Scyb1 | Gro-α, GRO1, NAP-3 | P09341 |
CXCL2 | Scyb2 | Gro-β, GRO2, MIP-2α | P19875 |
CXCL3 | Scyb3 | Gro-γ, GRO3, MIP-2β | P19876 |
CXCL4 | Scyb4 | PF-4 | P02776 |
CXCL5 | Scyb5 | ENA-78 | P42830 |
CXCL6 | Scyb6 | GCP-2 | P80162 |
CXCL7 | Scyb7 | NAP-2, CTAPIII, β-Ta, PEP | P02775 |
CXCL8 | Scyb8 | IL-8, NAP-1, MDNCF, GCP-1 | P10145 |
CXCL9 | Scyb9 | MIG, CRG-10 | Q07325 |
CXCL10 | Scyb10 | IP-10, CRG-2 | P02778 |
CXCL11 | Scyb11 | I-TAC, β-R1, IP-9 | O14625 |
CXCL12 | Scyb12 | SDF-1, PBSF | P48061 |
CXCL13 | Scyb13 | BCA-1, BLC | O43927 |
CXCL14 | Scyb14 | BRAK, bolekine | O95715 |
CXCL15 | Scyb15 | Lungkine, WECHE | Q9WVL7 |
CXCL16 | Scyb16 | SRPSOX | Q9H2A7 |
CXCL17 | VCC-1 | DMC, VCC-1 | Q6UXB2 |
Chimiokines C | |||
Name | Gene | Autre(s) nom(s) | Uniprot |
XCL1 | Scyc1 | Lymphotactine α, SCM-1α, ATAC | P47992 |
XCL2 | Scyc2 | Lymphotactine β, SCM-1β | Q9UBD3 |
Chimiokines CX3C | |||
Name | Gene | Autre(s) nom(s) | Uniprot |
CX3CL1 | Scyd1 | Fractalkine, Neurotactine, ABCD-3 | P78423 |
Les chimiokines sont classées en quatre sous familles en fonction de l'espacement entre deux de leurs cystéines en position N-terminale. La famille CXC ou alpha, dont les membres possèdent un acide aminé entre les deux premières cystéines.
La famille CC ou beta, dont les membres possèdent deux premières cystéines adjacentes
La famille CX3C ou delta, dont l'unique membre (la Fractalkine) possède trois acides aminés entre les deux premières cystéines.
La famille C ou gamma, dont l'unique membre ne possède qu'une seule cystéine
[modifier] Rôles biologiques
Toutes les chimiokines exercent leurs fonctions en se fixant sur des récepteurs couplés aux protéines G. Certaines chimiokines sont considérées comme pro-inflammatoires. La sécrétion de ces chimiokines peut être induite lors de la réponse immune afin de favoriser l'arrivée de cellules du système immunitaire au niveau d'un site infectieux. D'autres chimiokines sont impliquées dans le contrôle de la migration de cellules au cours des processus de maintenance tissulaire ou au cours développement. Une chimiokine particulière, la Fractalkine, est exprimée sous la forme d'une protéine membranaire et a une fonction d'adhérence cellulaire.