Utilisateur:Guillom/Biopuce
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Sommaire |
[modifier] Biopuce
Présentation générale ; sondes immobilisées sur un support, cibles en solution ; reconnaissance spécifique ; moyen de détection (fluo, elisa...)
[modifier] Principe général
Miniaturisation, meilleure sensibilité, meilleure spécificité, analyse d'échantillons rares
[modifier] Immobilisation des sondes
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Fabrication d'une biopuce à ADN (info) Une biopuce à ADN en cours de fabrication par un robot à l'Université du Delaware. Un problème pour lire la vidéo ? Voir l’aide.
[modifier] Reconnaissance spécifique des cibles en solution
[modifier] Lecture du résultat
[modifier] Méthode ELISA
[modifier] Fluorescence
Fluorescence, scanners à fluorescence
[modifier] Méthodes originales
microleviers (déflexion optique / changement de capacité)
Systèmes basés sur le système de microbalance piézoélectrique
[modifier] Biopuces à ADN
génétique, génomique, génome, bioéthique, Technique et méthode de la génétique, recherche pharmaceutique, Industrie pharmaceutique
[modifier] Autres types de biopuces
[modifier] Biopuces à anticorps
[modifier] Biopuces à protéines
[modifier] Biopuces à sucres
Glucide, Ose, Obésité, Diabète
[modifier] Acteurs académiques et industriels
- CNRS
- CEA
- Sanofi Aventis
- BioMérieux
- Affymetrix
- Agilent Technologies, filiale de Hewlett-Packard
- InnoBioChips
[modifier] Liens internes
- Génomique
- Protéomique
- Laboratoire sur puce
[modifier] Les puces à ADN
Qu'est-ce que c'est ? Une puce à ADN est une technologie récente permettant de visualiser les gènes exprimés (transcrits) dans une cellule d'un tissu donné (foie, intestin...), à un moment donné (embryon, adulte...) et dans un état donné (malade, saine...).
À quoi ça peut servir ? La comparaison de deux expériences de puce à ADN sur deux cellules du même type l'une saine et l'autre malade peut permettre de découvrir des gènes exprimés uniquement dans la cellule saine (ou uniquement dans la cellule malade): ces gènes sont certainement impliqués dans la maladie.
Comment c'est fabriqué ? La puce est une plaque de petite taille sur laquelle sont fixés des brins monocaténaires (un seul brin au lieu des deux habituels) d'ADN, chacun correspondant au brin complémentaire d'un ARN messager (ARNm). On peut fixer sur cette plaque plusieurs dizaines de milliers de fragments d'ADN (et donc étudier l'expression d'autant de gènes).
Les ARNm (provenant des gènes exprimés) sont extraits de la cellule à analyser et des fluorochromes sont fixés dessus. Puis l'échantillon des ARNm est versé sur la plaque: chaque brin d'ARNm va s'hybrider au brin monocaténaire d'ADN qui lui est complémentaire pour former un double brin. La plaque est ensuite nettoyée pour éliminer les brins d'ARNm ne s'étant pas hybridés.
Elle est ensuite scannée au laser et une image de la puce est créée : chaque fois qu'il y a eu hybridation, le fluorochrome fixé sur l'ARNm a émis dans la longueur d'onde du laser et cela est visible par un point de couleur (rouge pour des fluorochrome émettant dans le rouge...)
Comment on les analyse ? Des logiciels interprètent la luminosité de chaque point de la plaque contenant un ADN différent et en déduisent une mesure numérique de l'expression de chaque gène.
Et aussi... Il existe deux grandes familles de puces à ADN, l'une ne pouvant recevoir qu'un échantillon de cellule par plaque (mais pouvant contenir beaucoup plus de gènes fixés sur la plaque) et l'autre pouvant recevoir deux échantillons différents, chacun labellisé avec un fluorochrome de couleur différente : sur l'image, un point vert sera donc un gène exprimé dans la cellule saine tandis qu'un point rouge sera un gène exprimé dans la cellule malade. Un point jaune est exprimé dans les deux cellules et un point noir dans aucune...
Il existe aussi de très récentes puces à protéines qui permettent d'étudier le protéome d'une cellule donnée. Ce sont cette fois des antigènes qui sont fixés sur la plaque.
